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1、1目的 保证GeneAmp 7000型荧光定量PCR仪的正常使用。
2、 2 该SOP变动程序 本文件的变动,可由任一使用该文件的工作人员提出,报经室技术负责人,由季度组长会议决定。
3、如通过则公布实行。
4、 3 适用范围 GeneAmp 7000型荧光定量PCR仪。
5、 4 使用方法 ⑴依次打开电脑显示器和电脑主机电源开关,进入Windows 2000界面。
6、 ⑵接着打开PCR仪电源开关,预热5分钟。
7、 ⑶按需要在电脑上设定一个新的运行版面和程序。
8、 ⑷推开滑门,将样品放入样品槽内,关上仪器滑门。
9、 ⑸运行程序,在反应结束后按Save键储存实验结果。
10、 ⑹关闭PCR仪电源开关。
11、 ⑺分析实验结果;发放临床报告。
12、 5 注意事项 ⑴仪器应放置在水平坚固的平台上,外界电源系统电压要匹配,并要求有良好的接地线。
13、 ⑵环境温度保持在23℃左右,湿度保持在60%左右。
14、 ⑶仪器应配备功率≥3000W的稳压器。
15、 ⑷仪器应定期清洁维护。
16、 ⑸仪器使用时应严格遵守上述使用步骤。
17、 6 维护方法 6.1微软Windows 2000操作系统的维护 硬盘驱动器每月29日运行一次碎片清除程序,使用Norton Utilities或类似软件。
18、现以Norton为例: ①放入Norton Utilities光盘,运行安装(Setup)文件。
19、 ②安装完后取出Norton Utilities光盘,重新启动计算机 ③运行Norton Utilities软件,并启动其清理碎片/优化程序。
20、 ④运行完成后,检查以确信无严重错误记录,退出Norton Utilities。
21、 ⑤以后每次运行Norton Utilities软件中的清理碎片/优化程序就行了。
22、 6.2 7000 PCR扩增仪的维护 1.样品槽的清洁 样品槽每月29日进行一次清洁,如出现样品槽污染情况则随时清洁。
23、 操作方法: ①运行25℃HOLD程序使样品槽温度达到室温。
24、关闭仪器,等待10分钟。
25、 ②从样品槽移去样品架。
26、 ③在样品槽中加入少量95%乙醇,用棉签擦洗反应孔。
27、 ④用干棉签吸干乙醇。
28、 ⑤向里推动滑门,锁住,使样品槽升温到50℃,以蒸发掉多余的乙醇。
29、 2.热盖的清洁 热盖每月29日进行一次清洁,如有需要随时进行。
30、 ①运行25℃HOLD程序使样品槽温度达到室温。
31、关闭仪器,等待10分钟。
32、 ②逆时针旋转GeneAmp 7000光源检测器顶部旋钮。
33、向后推GeneAmp 7000光源检测器至滑轨距离的大约1/3处。
34、 ③GeneAmp 7000光源检测器滑轨上有缺口。
35、从这些缺口垂直抬起GeneAmp 7000光源检测器,小心侧放于仪器顶盖上。
36、不要从仪器取走热盖。
37、 ④用湿润的镜头纸清洁加热盖,待干。
38、 ⑤将GeneAmp 7000光源检测器重新安装回滑轨。
39、 6.3 GeneAmp 7000光路系统的维护 1.调准ROI参照条 调准ROI参照条在仪器更换卤素灯、仪器定期校准或仪器维修后进行。
40、不得由一般实验人员进行该项操作。
41、 ①推开滑门,在样品槽中放入荧光检测板。
42、 ②GeneAmp 7000仪器滑门向前滑移盖住样品槽,并关紧。
43、 ③从Start菜单或桌面点选运行GeneAmp 7000 SDS管理软件。
44、 ④积分时间从512ms开始,用位置调整点,调节ROI的高度与右边线。
45、 ⑤逐渐增加积分时间,直到可以看到至少四个块(约4096ms)。
46、 ⑥调整最左侧位置调整点。
47、 ⑦减少积分时间到1024ms,调整上方与底部的位置调整点。
48、 ⑧减少积分时间以便最右侧块可见但未饱和(约512ms),调节最右侧位置调整点。
49、如有需要用右上角拖动点调整图象的倾斜度(以左上角为中心旋转)。
50、 ⑨调节后的参照条宽度必须在ROI参照块间有小空隙。
51、 2.校正ROI光路 ROI光路校正每月29日进行一次,以便确信结果仍然是优化的。
52、 ①推开滑门,在样品槽中放入荧光检测板。
53、 ②GeneAmp 7000仪器滑门向前滑移盖住样品槽,并关紧。
54、 ③从Start菜单或桌面点选运行GeneAmp 7000 SDS管理软件。
55、 ④点选Show ROI复选框。
56、每个样品孔周围出现一蓝色椭圆圈。
57、 ⑤点选Show Saturation复选框。
58、 ⑥设定积分时间为1024ms;打开卤素灯和光闸。
59、 ⑦点击LIVE按钮获取图象,然后在任何地方左击停止。
60、获取中等程度未饱和图象(无红色图象)。
61、 ⑧从Edit菜单中选择Calibrate ROIs每个孔都会选取合适的ROI,确定96孔都被蓝色椭圆圈正确界定。
62、 ⑨图象太亮太暗都会出现错误信息,相应增加或减少积分时间,并重复上述第8步直到无错误信息出现。
63、 ⑩检查孔ROI位置,所有孔信息都应包含在96个ROI椭圆圈中。
64、如果没有,重复8和9步。
65、 3.检查样品槽的荧光污染 检查样品槽的荧光污染每月29日进行一次,如有需要随时进行。
66、 ①开启GeneAmp 7000型荧光定量PCR仪电源。
67、 ②从Start菜单或桌面点选运行GeneAmp 7000 SDS管理软件。
68、 ③从样品槽中移去反应板。
69、GeneAmp 7000仪器滑门向前滑移盖住样品槽,并关紧。
70、 ④单击New Document建立一个新的GeneAmp 7000文件 ⑤点击instrument中的catibrate显示ROI inspector窗口 ⑥把Exposure Time调到最大,把Capture image From调到最敏感的FiterB点,单击Snapshot获取图象。
71、 ⑦减少积分时间,改变Capture image From中的A,B,C,D单击Snapshot 观察96孔中背景荧光。
72、如孔有显著荧光则表示该孔存在荧光污染。
73、 ⑧按照样品槽的清洁程序清洗样品槽4.更换卤素灯 仪器使用大约2000小时后应更换卤素灯。
74、 ①关闭仪器,冷却15分钟。
75、 ②将样品板放入仪器样品槽,关闭滑门。
76、在仪器的顶部向上打开灯舱门。
77、 ③拧下固定灯罩的螺丝,将灯罩向前滑移,使其从设备上取下。
78、 ④将旧灯泡向前滑移,使其从夹状支架上取下,并将灯泡从灯座上拔下。
79、 ⑤把新灯泡尾部的插杆插入灯座上的插孔,使二者连接起来。
80、 ⑥使灯的长轴与仪器前向平行(即竖直于地面),将新灯泡滑回灯位。
81、 ⑦在灯舱门处于打开状态下,打开仪器,确证在仪器运行时灯也能打开。
82、 ⑧盖上灯罩,拧紧螺丝,关上灯舱门。
83、 ⑨若新卤素灯不工作,GeneAmp 7000电源保险丝可能有问题。
84、 7 校准 GeneAmp 7000型荧光定量PCR仪为复杂精密仪器,其校准工作需由专业工程师进行。
85、除与仪器厂家达成协议定期校准以外,以实验判断仪器校准状态也可为何时进行仪器校准提供信息。
86、 ⑴通过对室内质控图的分析,我们可以及时发现系统误差的出现。
87、经过分析排除了试剂和人员误差后,应怀疑是否仪器出现了检测偏差需要校准。
88、此时进行仪器状态效验实验确定是否需要进行仪器校准。
89、 ⑵仪器状态效验试验 ①使用标准化试剂作为效验试剂。
90、 ②在仪器处于校准状态下,由固定人员用标准化试剂对102、103、104、106标准品进行扩增实验。
91、该实验在两个月内应进行20次。
92、分别计算标准曲线的斜率、截距、相关性的控制限。
93、 ③每年6月、12月由固定人员进行上述实验,观察标准曲线的三个参数是否处在控制范围和102标准品是否检出。
94、 ④当102标准品未检出、标准曲线的三个参数超出控制范围或仅出现后者时,先排除实验的人员、试剂因素,再重复实验。
95、如结果依然,联系厂家立即进行仪器校准。
96、 ⑤当仅有102标准品未检出时,检查实验全过程。
97、再次上机检测102标准品 两枚。
98、仍未检出联系厂家进行仪器校准。
99、 ⑥仪器经过校准后,重复该实验。
100、结果归入仪器档案。
101、标本前处理标准操作程序 1 目的 保证标本处理标准化、规范化,使不规范操作因素对实验结果造成的影响减至最小。
102、 2 该SOP变动程序 本文件的变动,可由任一使用该文件的工作人员提出,报经室负责人决定。
103、如通过则公布实行。
104、 3 适用待处理标本范围 临床基因扩增实验室现行检测项目。
105、 4 标准操作程序 4.1 DNA血清类(例如HBV) ⑴双手戴上手套,从冰箱取出标本,将验单和试管依次编号,收起验单,弃去手套。
106、 ⑵双手换上新手套,用镊子(夹取灭菌物品专用)取出1.5ml离心管,对应标本编号,置于离心管架上。
107、 ⑶将移液器调到50µl,先吸取50µlDNA提取液加入到编好号的离心管中。
108、然后吸取50µl血清,加入离心管中混匀,注意每吸取一份血清标本应更换一次枪头。
109、处理全部标本,然后将离心管插到水浴板上,用镊子放入水浴锅,沸水浴10分钟。
110、 ⑷水浴完成后用镊子将水浴板取出,转至4℃静置8~12小时,然后10000转 5分钟离心,取上清液2µl点样上机。
111、 ⑸收拾台面至准备状态。
112、 4.2 RNA血清类(例如HCV) ⑴双手戴上手套,从冰箱取出标本,将验单和试管依次编号,收起验单,弃去手套。
113、 ⑵双手换上新手套,用镊子(夹取灭菌物品专用)取出0.5ml灭菌离心管,对应标本编号,置于离心管架上。
114、 ⑶先用5~40µl的移液器,吸取10µlRNA提取液A加入到编好号的离心管中,再用40~200µl的移液器吸取50µl 血清加入,最后用200~1000 µl移液器加入200 µlRNA提取液B,在震荡器上震荡混匀,冰上放置5分钟,然后6000转1分钟离心。
115、 ⑷去上清,留沉淀。
116、加入450µl 用DEPC水配制的75%的预冷乙醇洗涤沉淀,然后6000转1分钟离心,去上清。
117、相同方法再洗一次,吸干上清,65℃10分钟烘干。
118、 ⑸给烘干的沉淀中加入18 µl的反应液I,混匀,再加入2 µl逆转录酶,充分混匀,瞬时离心(3秒),放入温箱,37℃45分钟逆转录。
119、 ⑹逆转录后95℃3分钟高温灭活,瞬时离心(3秒),取5 µl上清立即点样上机。
120、 ⑺收拾台面至准备状态。
121、 4.3 分泌物类(例如CT) ⑴双手带上手套,从冰箱取出标本,将验单和试管依次对应编号,收起验单,弃去手套。
122、 ⑵双手换上新手套,用镊子(夹取灭菌物品专用)取出1.5ml离心管,对应标本编号后,置于离心管架上。
123、 ⑶用镊子拧下全部试管盖并依次置于实验台面上,试管对应放置于试管架上。
124、 ⑷向每只试管中缓慢加入1ml无菌生理盐水。
125、 ⑸用左手取试管于旋涡振荡器上充分振荡。
126、 ⑹将试管中的洗脱液全部转至相应离心管。
127、 ⑺将试管和离心管分别放回试管架和离心管盒中前一排对应位置,并用镊子将管盖对号盖回,把试管架放回冰箱。
128、 ⑻双手换上新手套,用左手将离心管全部配平,按顺序置于离心机中相应位置,以 12000转离心5分钟。
129、去上清,沉淀再加1ml生理盐水打匀,15000 rpm离心5分钟。
130、(如超过12管,则需分批进行)。
131、 ⑼离心完毕后,左手取出离心管,倾倒上液,再瞬时离心,右手取移液器将管内残液吸尽,只留下沉淀。
132、如无明显肉眼可见沉淀,则可在管内留下约50µl液体。
133、 ⑽依次向管中各加入50µlDNA提取液,此时移液器应与管壁约成30度角,吸头抵至沉淀上方靠管壁处,来回抽吸,将沉淀与DNA提取液混匀。
134、 ⑾将加入DNA提取液的标本沸水浴10分钟。
135、 ⑿将沸水浴后的标本放置至室温,并将其放入4℃冰箱中6~8小时保证充分裂解。
136、 ⒀离心标本10000 转5分钟。
137、 ⒁换上新手套,取上清液2µl点样上机。
138、 ⒂收拾台面至准备状态。
139、 4.4痰液类(例如TB) ⑴取晨痰加入4倍体积4%氢氧化钠待其充分液化(30分钟),液化过程中,振荡2~3次,如痰液粘稠,可延长液化时间。
140、 ⑵取1 ml消化液加入离心管,10000转离心5分钟 ⑶弃上清留沉淀,加入1ml生理盐水洗涤,10000 转 5分钟离心。
141、 ⑷重复⑶操作,留沉淀,加入50µlDNA提取液,混匀。
142、 ⑸沸水浴10分钟,4℃放置8~12小时。
143、 ⑹10000 转5分钟离心,取上清2µl点样上机。
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